案件处理分为立案侦查、审查起诉、审判三个阶段。侦查阶段发现证据不足，应当撤销案件。审查起诉阶段发现证据不足，人民检察院可以做出不起诉决定，也可以将案件发回要求补充侦查。审判过程中发现证据不足，人民法院发现证据不足不符合起诉条件，可以撤回起诉，对于认定需要补充侦查的，应退回公安机关要求补充侦查。 《刑事诉讼法》第一百六十一条，在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。《刑事诉讼法》第一百七十一条，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。《刑事诉讼法》第一百七十三条，犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十五条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。《刑事诉讼法》第一百七十四条，不起诉的决定，应当公开宣布，并且将不起诉决定书送达被不起诉人和他的所在单位。如果被不起诉人在押，应当立即释放。